Akıllı Telefonunuzun İçindeki DNA Analizörü: iGenomics

Elinizde taşıyabileceğiniz küçük bir cihaz ile akıllı telefonunuzdaki bir uygulamayı kullanarak DNA analizi yapabileceğinizi söyleyen bir bilim kurgu filmi değil, Gigascience dergisinde yayınlanan çalışma gelinen son noktaya ışık tutuyor.

CSHL araştırmacıları, iGenomics adlı yeni bir iPhone uygulaması olan, dünyanın ilk mobil genom sekans analizörünü geliştirdi.

DNA analizi yapabilen mobil bir uygulama olan iGenomics ve bir DNA sıralayıcısı olan Oxford Nanopore'un USB boyutlu MinION kombinasyonu, genom analizini taşınabilir ve erişilebilir hale getiriyor.

Herkesin mobil bir ortamda DNA dizilerini kolayca hizalayıp analiz etmesine olanak tanıyan iGenomics, genel yazılım olarak okuma hizalama ve varyant çağırma için aynı yüksek performanslı algoritmaları kullanırken ilgili kritik mutasyonları incelemek için ek özellikler içeriyor.

Gigascience dergisinde yayınlanan çalışma, iGenomics algoritmasının Zika virüsü gibi viral patojenlerin DNA dizilerini hızlı bir şekilde haritalandırabildiğini, teşhis ve tedavi için önemli olan mutasyonları belirleyebildiğini gösterdi.

Bir sonraki hedefin bu sistemi uzayda kullanılabilir hale getirmek olduğunu söyleyen araştırmacılar, vizyonlarını ortaya koyarken, önümüzdeki birkaç yıl içinde hepimizin akıllı telefonlarımızda kendi DNA sıralayıcılarımızı taşıdığımızı hayal etmek o kadar da zor değil.

Çalışma detayları:

Palatnick A, et al. iGenomics: Comprehensive DNA sequence analysis on your Smartphone, GigaScience, Volume 9, Issue 12, December 2020, giaa138. https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa138